Thursday, March 03, 2011

fenol; molecular weight 94.11

Total RNA extraction Lopez–Gomez & Gomez-Lim. Nak pahamkan method nye ajer dah naik pening belum sebut lagi nak prepare reagents. It’s a manual extraction to begin with and it took about 3 days to get the result. Terpikir dan terus bertanya; why don’t we use the extraction kits instead? Co-sv replied; you will never learn anything. Oh well, actually I don’t give a damn about learning anything. Really... really... wanna finish the labworks.

Minggu pertama di lab baru dah mcm2 dugaan. Selain daripada postgrade students yang ‘berat mulut’ nak berkongsi, perangai undergrade students yang suka bergurau senda setiap masa wpun ketika bekerja ngan EtBr, tiada space untuk menulis apatah lagi untuk duduk rehat di bilik postgrade, makmal yang dibanggakan yuu key emm ini juga tergendala air-cond nya. Semua nya merimaskan!

Paling membuatkan rasa lebih cepat siap lebih baik insiden ketika sedang menyediakan larutan fenol (phenol solution). Puas membelek chemicals depan mata, yang terjumpa hanya phenol in white crystal form bukan dalam larutan seperti selalu. Emm..mcm mana yerk nak buat ni? Tertanya2 dalam hati sambil mata mencari postgrade student yang pernah melakukan method yang sama. Budak baru belajar lebih baik bertanya daripada buat kerja membabi buta. Macam mana yea nak wat solution phenol ni? Student Msc tersebut menjawab selamba; biasanya kitaorg timbang dulu pastu dissolve je la. Belum sempat bertanya lebih detail, dia dah blah meninggalkan.

Otak mula berkira2. Dissolve? Dalam solvent tertentu atau dlm air? Aiseh apsal tak ingat hah ms blaja organic chem. Takpe internet kan ada. Ahah..! Phenol dissolves in water moderately and form two layers. Dengan best nya, fenol berjaya dilarutkan. Timbul plak problem baru, nnt masa nak extract nak amik upper layer or bottom layer? Aduhh..ni yang wat tensen. Istilah budak baru belajar, mencari2 seseorang untuk diwawancara. Err..sorry eh. Lepas larutkan fenol nnt kena amik which layer for RNA extraction? Student phD memandang; lapisan atas. Owhh..thanks. Sedang berkira2 menuang kloroform, Student phD tersebut masuk ke lab. Ehh..you buat apa ni? Cepat je mulut berkata. Phenol solution. Kita tak buat phenol mcm ni maa...it’s equilibrated phenol. We used tris-HCL. Terkesima kejap. What?? Mahu jer mulut bercakap, **** tak kata ia equilibrated phenol, but then erm..tak pe lah, malas nak memanjangkan citer. Student phD tersebut memberi method equilibrated phenol. Agak banyak solution tris-HCl dengan molarity yg berbeza perlu dibuat.

Bekerjasama dengan student MSc yg baru, kebetulan menggunakan method isolasi yg sama membahagikan tugas. Dia sediakan tris dengan molarity berbeza manakala aku mencairkan fenol dlm waterbath. Hati ingin menduga students di makmal ini. Sekali lagi bertanya pada students MSc yang sama. Biasa nya kalo nak cairkan fenol, letak dalam apa? Dia menjawab. **** biasa nya timbang pastu letak dlm botol. Jangan campur dengan air. Lantas, schoot 1L menjadi pilihan di dlm waterbath sambil memasukkan fenol sedikit demi sedikit. Opps.. phenol can caused burn injury if they contacted with human skin. Student phD yang sama datang mendekati. Ehh..you buat apa ni? Ringkas menjawab. Larutkan fenol. Kenapa ehh you wat camni, bahaya maa kalo fenol kena kat kulit you nnt terbakar! Lantang suara nya semua students yang ada mendengar. Perasaan bengang bercampur malu. Annoyed pun ada skali. Bukan nya dilakukan sambil bergelak ketawa tanpa gloves and labcoat. Dalam fume hood lagi. Dah nak wat camne!?

Lantaran kebengangan, keputusan melarutkan fenol dilakukan dengan memasukkan sebotol chemical phenol sekali gus dlm waterbath. Huhh..amik sebijik!!..agaknya jelas terpamer kat muka, student Msc baru berkata. Kenapa diaorg tak bgtau awal2? Ni dah buat baru nak cakap. Hati berkira2 agaknya sebab diorg dah expert dan tak nak berkongsi tapi alhamdulillah, equilibrated phenol berjaya dihasilkan berkat kesabaran. Tapi selalu berdoa agar lebih sabar mengendali attitude students di makmal ini berbanding bebanan labwork itu sendiri.

6 comments:

Opie said...

Hahaha!

I was reading the beginning of your entry and I was like, "Urm, apsal Ann guna pure phenol..? tak jahanam ke extract dia!?" XD

Btw, Kita pernah buat extraction ni masa undergrad (we didn't make the equilibrated phenol though..)

But I remember spending WAY too much time trying to get the aqueous layer on top (that contains the DNA) without touching the contaminating proteins and stuff at the bottom.. Ingat tak? Kita duk extract DNA daun kut masa tu..

Ann, ini namanya sengaja cari penyakit.. your SV should be fired -_-v I mean, what is the point of DNA kits if you always have to go back to ancient methods!??

But good luck to you, superfox! Nanti Ann jadi SV jangan mintak your students buat benda2 tak berfaedah camni yea..^^

lyana sidek said...

Ann! saya pun dah rasa kena marah sekali..ingat nak senyap2 aje..simpan sorang2..sekali tengah memendam rasa dalam surau tiba2 ada panggilan dari belakang.. nurul lyana, nurul lyana.. mun rupanya!!! saya pun apa lagi terus berdrama dengan mun..sedih la ann.. saya ni dah la lambat "pick up"..

Anonymous said...

i pun pernah jugak buat aksi bimbo time nak buat serial dilution.

sabar jer lah dengan diri i nih.



huhuhuhuh...biasalah tu ann, saya lagilah banyak benda tak pandai nak buat....huhuhuuuhu...inilah akibatnya kalau tak banyak lab skill, tapi nak jadi orang lab...huhuhu

lutfi lukman said...

Mula2 dulu nak wat glycerol stock bacteria. Botol dah botol glycerol, tp kenapa kalernya hijau dan ianya agak cair? Fikir dlm hati, "glycerol sini lain kot..."
Masa tgh tuang tu ada senior menjerit, "Hey, itu WASTE!"
Malu gile kot glycerol ngan waste pun takleh beza. Baru perasan ada tulis 'waste' dgn marker :P

Shana said...

kita semua ada bimbo moments kat lab. sy plak masa nk purify dna dari gel electrophoresis, terus gi view under UV. jahanam la sampel tu. huhu..

Ann said...

@kak op
very tedious bila guna conventional method ni but alhamdulillah sy dapat RNA purity & conc. >2 hehe...

@nurul
u have to be strong!! sy pernah kena marah ngan SV smp 2 hari sy tak msk lab. mmg rs cam teruk sgt smp satu tahap tu bila jmp SV sy rs fobia kat dia. hehe..kalo ada prob nnt kita share sama2! jgn pendam.

@pojan
tu la pasal. kadang2 bila blaku perkara2 cmni buat sy terpikir.
sy ptt gi interview jadik pembaca berita tv. hoho

@luppi
hahaha..sbnr nya sy pun ada citer yg sama. tp botol kloroform yg tak jelas label nya WASTE. mula2 tuang tu, jelas color nya kuning ingat kan chemical tu dah lama. tp nsb baik sy tny.
Ni botol WASTE maa..awk tak nmpk ke sy dah tulis?! malu jgk la..

@shana
yup..mmg bnyk bnd. tp kan yg wat bengang tu, bila kita bertanya cara elok, students ni wat bodoh je. bg jwpn pun cam tak ikhlas.huhh..mmg kesabaran membakar fikiran.